Özellikle gıda üretiminde kullanılan araçların, canlı hayvanların kanlarında bulunan mikroplardan arındırılması ve gıda ürünlerinin doğal koşullarından ötürü tüketilmeye hazırlanması aşamasında; bir takım hijyen işlemlerine tabi tutulmaları zorunludur. Sanitasyonda bu hijyen tedbirleri arasında gelmektedir. Sanitasyonun uygulanması temizlik kurallarının ihlal edilmesi sonucunda bireyden topluma gidebilecek olan hastalıkların önüne geçilmesi için büyük bir önem taşımaktadır.
Sanitasyonun amacı; toplum sağlığını korumak, biyolojik korunmayı sağlamak ve üretimde hijyeni tesis etmektir. Sanitasyon işlemleri üretim sürecinde tamamen hijyen kurallarına uygun olarak mikroorganizmaların mevcut ortamdan uzaklaştırılması demektir. Ancak bu aşamada sorun yalnızca ortamda bulunan mikroorganizmalar değil, aynı zamanda taşıyıcı olabilecek personel yüzünden de ortamda var olabilecek mikroorganizmalardır.
Dezenfeksiyon işlemi iki şekilde gerçekleştirilir. Biri ısı yöntemi ile dezenfeksiyon diğeri ise yüksek düzeyli dezenfeksiyondur. Genellikle, dezenfeksiyon işlemleri sırasında kimyasal maddeler kullanılır. Ancak bunun dışında UV ışını ile yapılan dezenfeksiyon işlemi de vardır ki lokal olarak oldukça etkilidir.
hijyen, sanitasyondan farklı olarak sağlıkla ilgili kuralları koyar. Yani, bir ortamın ya da bir eşyanın hijyenik olmasının ölçütü olan kuralların toplamıdır. Ancak sanitasyondan ayrıldığı tek nokta bu değildir. Sanitasyon gıda sektöründe kullanılırken hijyen tıp alanında daha çok geçerlilik kazanmıştır.
